二零二零至二零二一年事工中心為「作主門徒」，以塑造一個合主心意的屬靈群體為目的，倡議踐行敬虔生活，樂於常傳福音，並殷勤不懈事奉、在人前作鹽作光。
本年發新型冠狀病毒肺炎於全球肆虐，導致全年不少事工活動及計劃受影響，需改以其他形式進行（如以網上視象會議形式進行）、延期甚至取消。
一月
1月 臨床心理服務製作【關心疫境、逆境下的你】短片，藉此幫助更多人以正面及積極的態度面對艱難時刻。
1日 錦江紀念禮拜堂李祖耀牧師（服務本會31年）、國語堂鄭大成牧師（服務本會12年）及區會同工吳穗萍女士（服務本會40年）榮休。
4日 信徒培育部兒童事工小組假協和小學（長沙灣）舉行「與SEN孩子分享信仰工作坊」，由余枝鳳博士擔任講員，分享主題：軟弱中彰顯主大能，基順愛的家劉寶珊牧師及基順學校宗教主任鄭嘉慧老師分享健障共融教會的實務分享。
5日 野外福音事工小組（勇獅）舉辦1月會員免費活動：「獅子山上、山下」。
6日 大埔堂退休牧師張展南牧師主懷安息。
14-15日 教育心理服務於區會禮堂舉辦「精神健康急救——關懷青少年版課程」培訓工作坊，對象：本會中、小學教師，由香港心理衛生會認可導師容美韶女士及曾令珍女士擔任講員，第一輪講座如期順利舉行；原定第二輪講座於6月4-5日舉行，受疫情影響而取消。
17日 中學校長會「副校長及中層管理培訓小組」假啟愛學校舉行法律講座，主題：「近期社會運動中的相關法律權益——法律資訊與實例」，由香港中文大學教育學院客座副教授林壽康退休大律師作專題演講及實例分析。
24日 本會發出【就近期的「新型冠狀病毒疫情」向各堂作以下的邀請和建議】。
25日 香港閩南堂蘇宗仁長老主懷安息。
29日至2月1日 因新型冠狀病毒肺炎在本地爆發，疫情嚴重，區會辦公室暫停辦公，所有同工在家工作。
二月
2月 岑樹基牧師繼續外借（請調）往香港教育大學基督教信仰與發展中心擔任主任，為期3年。
2日 野外福音事工小組（勇獅）舉辦2月會員免費活動：「將軍！石」。
3日 因應新冠肺炎疫情嚴峻，區會響應政府的僱員辦公室特別安排，安排大部份同工在家工作及在總辦事處輪流當值，上述安排隨政府宣佈逐步恢復公共服務，於3月2日結束。家庭支援服務中心亦於本月中開始不對外開放，並暫停或延期各類輔導服務、活動、講座及課程，但維持透過電話或電郵為有需要人士提供免費諮詢服務。
4日 神學牧職部社會關注小組發出【就新型冠狀病毒肺炎疫情於香港持續擴大表示關注】 。
4日 因新冠疫情關係，區會總辦事處太子道西入口關閉，直至全港小學高年級於6月8日復課日才重新開放。
13日至4月29日 神學牧職部社會關注小組透過區會網頁及區會手機應用程式，每星期發出禱文一篇共12篇，呼籲信徒在新型冠狀病毒肆虐情況下，為疫情禱告。
14日 神學牧職部發出【就香港疫情嚴峻時期各堂崇拜和聚會的安排建議】。
17日 望覺堂梅勤官執事主懷安息。
三月
8日 本會神學教育主日。
9日 神學牧職部舉辦「牧職成長」研討會，由麥漢勳牧師及牧職專業發展小組成員帶領分享。
12日 國語堂陳李哲生執事（已故陳先鵬牧師之夫人）主懷安息。
17日 神學牧職部舉辦「疫情下的牧師與牧養」分享會，由吳炳華牧師、林玉英牧師及陳誠東牧師分享。
20日 6所直屬幼稚園老師原定舉辦幼稚園聯會教師發展日，因受疫情影響決定取消。
23日至5月4日 因本地疫情再趨嚴峻，區會再度響應政府實施公務員在家工作安排，恢復大部份同工在家工作及在辦公室輪流當值。
四月
1日 柴灣堂董美琴牧師（服務本會31年）榮休。
9日 本年基督設立聖餐日聯合聖餐崇拜主題為「愛到底」，因疫情持續取消實體聚會，只有負責崇拜儀節的牧師親身參與，並安排網上直播。
15日 福音事工部學校事工小組於下午以視象會議方式，舉辦了中學校牧交流會，共有15位同工參與。
20日 已故黎光牧師之夫人黎譚琼仙師母主懷安息。
22日 福音事工部學校事工小組於下午以視象會議方式，舉辦了小學校牧交流會，共有20位同工參與。
24日 神學牧職部社會關注小組發出【呼籲中央政府對香港貫徹「一國兩制、港人治港、高度自治」的聲明】。
25日 原定假長老堂舉行之區會模範生頒獎禮受疫情影響決定取消，模範生之獎狀及水晶由各校自行安排頒發。
五月
5月 本會終止由本會按立為牧師之陳偉文「中華基督教會牧師」之身分。
本月中，福音事工部學校事工小組向各校校長、教職員、各堂會中負責校牧事工的團隊發放了打氣咭，鼓勵眾人在疫情中互相鼓勵，繼續堅守校牧事工的牧養關顧。
2日 本會退休校長、望覺堂執事關王秀貞校長主懷安息。
16日 原定假長老堂舉行之學校教職員工長期服務感謝狀頒發典禮暨聚餐，受疫情影響一度延期至7月4日舉行，後決定取消。本年合共173位同工獲獎：5人服務滿40年，10人服務滿35年，60人服務滿30年，98人服務滿25年，58人服務滿20年。
20日 原定舉行之小學聯校畢業典禮受疫情影響決定取消，畢業特刊繼續出版。
29日 晚上信徒培育部青年小組舉辦「青年敬拜晚會‧一年」，共39人參與。
31日 本會分享主日，是年所收奉獻，用以撥助廣東省基督教兩會山區教牧同工津助及愛德基金會—「活水行動」淨水計劃（內地清海省、緬甸及尼泊爾）。
六月
6-7月 本年區會直屬及有關學校舉辦共11節法團校董會校董培訓課程。
1日 鰂魚涌堂梁佩瑤牧師（服務本會37年）榮休。
2日 晚上神學牧職部社會關注小組暨信徒培育部聯合舉辦「法律之下，人人平等」講座，由張達明律師及邢福增教授擔任講員，副總幹事回應；講座以網上視像形式進行，共56人出席。
15日 本月執行委員會議決英華堂分堂馬禮遜堂因屢經勸戒後，仍不願遵守本會【區會憲章】及【聖職人員聖禮公儀】，自行按立牧師，故不再登記為本區會之成員之一，與本區會沒有任何關係；馬禮遜堂堂主任鄭以心牧師也不再是「在職本會牧師」。
22日 宣教師團契舉行網上視像聚會，主題：「網絡生態與牧養」，由任志強博士擔任分享嘉賓。
24日 原定舉行之直屬幼稚園聯校畢業禮受疫情影響決定取消，畢業特刊繼續出版。
25日 野外福音事工小組（勇獅）舉辦6月會員免費活動：「水清沙幼漫遊浪茄」。
26日 原定舉行本年度青少年奮進向上計劃重聚日，受疫情影響延期至2021年新一屆計劃之重聚日同時舉行；而原定需於本年6月30日前完成津助款項之本年度29位獲批款同學，將可延期至2021年6月30日完成津助款項。
27日 原定舉行本會2020年全港賣旗日，受疫情影響，取消戶外賣旗活動，以推動認捐電子金旗及磁石貼金旗代替，本年度共籌得逾172萬元。
七月
13日 富善懍遵堂（原富善堂）遷至已停止聚會之懍遵堂原址並正式運作。
因本地疫情再趨嚴峻，區會總辦事處太子道西入口再度關閉，直至9月23日因應學校開始復課，太子道西入口重開。
神學牧職部舉辦「活在當下，牧養真難」分享會，由高國雄牧師帶領分享。
20日至8月24日 因本地爆發第三波疫情，區會再度響應政府實施公務員在家工作安排，恢復大部份同工在家工作及在辦公室輪流當值。
25日 信徒培育部兒童事工培訓小組原定於區會舉辦之「表達藝術治療工作坊」，受疫情影響決定取消。
28日 元朗堂退休牧師李靈恩牧師主懷安息。
八月
1日 高國雄牧師外借往香港中文大學崇基學院擔任校牧，為期2年。
20日 學務部原定於7月中舉行之新入職校長簡介會，受疫情影響，延期至本日透過網上會議進行。
22-23日 青年小組部份成員、憐城決成員及本會公費神學生，出席了世界傳道會舉行之青年視像會議CWM 2020 Asia Youth Initatives “Rising to Life in the context of Covid-19”。
九月
9月 新學年共有三名公費神學生：林顯基（柴灣堂，崇基學院神學院神道學碩士三年級）、劉俊謙（屯門堂，崇基學院神學院神道學碩士三年級）及楊嘉瑩（梁發紀念禮拜堂，崇基學院神學院神道學碩士二年級）；六名申領神學培才助學金神學生：莫淑麗（協和堂，中華神學院神學學士四年級）、黃海樑（錦江紀念禮拜堂，中國神學研究院道學碩士三年級）、林凱倫（協和堂，中國宣道神學院道學碩士三年級）、黃進輝（基灣堂，中國宣道神學院神學學士三年級）、吳黛玲（馬灣基灣堂，信義宗神學院道學碩士三年級）及李家豪（協和堂，中國神學研究院道學碩士二年級）。
學前駐校社會工作服務出版了第一期家長通訊及《童心復課Go Go Go》小冊子，分別派發予各學前單位的家長及學生；另社工分成小隊製作家長小錦囊支援家長，第一輯是「如何處理孩子分離焦慮及不願出門上課」。
1日 本學年新聘校長：薛昌華校長（扶輪中學）、鍾惠娟校長（拔臣小學）、林逸龍校長（全完第二小學）、彭潔嫻校長（基真小學）履新。校長離任：全完第二小學李德衡校長（服務本會兩年）離任；校長調任安排：原扶輪中學劉家倫校長調任為基朗中學校長。
校長榮休：基朗中學羅紹明校長（服務本會9年）、基真小學洪之龍校長（服務本會14年）及拔臣小學劉餘權校長（服務本會38年，包括4年擔任校長）榮休。
區會新任學務總監陳俊傑先生履新。
區會學務總監陳紹才先生（服務本會25年）榮休，龍門堂麥兆輝牧師（服務本會9年）榮休。
4日 基灣堂李潤成牧師（服務本會逾21年）榮休。
4日至10月16日 逢星期五晚上於區會舉行一連6講之本年度長執訓練課程。
14日 神學牧職部舉辦「時代宣言的反思」研討會，由蒲錦昌牧師分享。
家庭支援服務中心全面恢復提供面見輔導服務，以及按個案需要提供網上輔導服務。
17日 本會發出【執行委員會就遴選下任本會總幹事的公告】。
8-10日 原定假上水聖保祿樂靜院舉行之「藝術靈修」宣教師退修會，受疫情及限聚令影響，延期至翌年2月舉行。
18日 神學牧職部舉辦候任牧師講座，探討聖禮之施行及其他禮儀；又於10月6-8日舉行差遣宣教師／候任牧師／接納牧師退修會。
20日 本會教育主日。
十月
1日 區會新聘兼職培訓統籌陳紹才先生履新。
1日至2021年4月30日 社會服務部推出2020-2021年度慈愛券；2019-2020年度慈愛券共計籌得逾港幣48萬元。
11日 本會區會主日：為區會福音事工、人才培訓事工、教育事工及社會服務事工籌募200萬元經費。
15日 神學牧職部社會關注小組發出【就警方修訂《警察通例》下「傳媒代表」定義表示關注】。
17日至11月2日 福音事工部學校事工小組向本會各校之校牧團隊發送【政治及教育制度轉變對校牧的影響】問卷，期望瞭解他們的憂慮與想法，及考慮如何作出支援；共有6間中學及5間小學的校牧團隊回應。
24日 上午假長老堂舉行按立牧師、接納牧師暨差遣宣教師感恩崇拜，由陳勉宜牧師證道，按立梁兆芬宣教師（基道旺角堂）、陳智衡宣教師（沙田堂）及劉龍華宣教師（全完堂）為本會牧師，接納林鍵牧師（公理堂）為本會牧師，並差遣李少華（傳恩堂）、李志偉（天約堂）、李健文（基灣堂）、梁恩榮（天約堂）、黃恩淞（大角咀基全堂）、歐基立（公理堂）、鄭嘉慧（沙田堂）及鍾嘉媛（天愛堂）為本會宣教師。因疫情關係，感恩崇拜只供本會出席及列席之執行委員及獲邀人士參與，並安排網上直播聚會。
下午二時三十分於長老堂舉行二零二零年周年代表大會感恩崇拜，由基督教香港崇真會總牧朱永生牧師宣道。同日四時三十分於協和小學二校地下禮堂及小禮堂舉行二零二零年度周年代表大會議事會，會議中選出新一屆12位執行委員，名單如下：（男界）陳應城、黃成榮、吳家偉、歐陽志剛；（女界）李淑儀、曾詠珊、梁美蘭、陳敏兒；（青年）馮詩愉、周永健、甯田安、陳卓雲。
31日 上午教育事工部假長老堂及協和小學舉辦「加強中、小學銜接交流座談會」。
十一月
3-5日 本年度牧師退修會於上水聖保祿樂靜院舉行，主題：活在大時代的生命自處，共有38位在職及已退休牧師參加。
6日 基灣堂首任牧師李暉明牧師之夫人李張祝屏師母在美國洛杉磯主懷安息。
7日 本會支持之崇基學院神學院舉行神學日慶典；本年因受新冠肺炎疫情影響，典禮不設公眾人士現場參與。當天本會公費神學生林顯基（柴灣堂）獲頒教會合一獎學金；本會應屆畢業公費神學生黃宇軒（錦江紀念禮拜堂）及本會會友張筱瑋（基灣堂）同獲頒洪德身神學教育獎學金，黃宇軒另憑論文：【探討臨在神學的校牧事工實踐——以中華基督教會校牧事工為例】獲頒基督教中國宗教文化研究社獎學金，張筱瑋另獲頒忠心良僕獎學金；本會會友關曦朗（合一堂馬鞍山堂）獲頒社會公義獎學金。由本會支持之汪彼得牧師紀念獎學金頒予黃泳釗（循道衛理聯合教會將軍澳堂），由長洲堂支持之中華基督教會長洲堂獎學金頒予萬家諭（上水浸信會）。本會蒙民偉書院退休校長葉信德（金巴崙長老會道顯堂）獲頒吳天安牧師伉儷講道科獎學金、最具牧者心腸之神學生獎學金及傑出神學生獎。
本年度應屆畢業之本會會友共六位，包括公費神學生黃宇軒（錦江紀念禮拜堂）獲頒神道學碩士（MDiv）；蘇明沅（公理堂）獲頒教牧學碩士（MM）；張雪儀（屯門堂）、梁瑞基（合一堂九龍堂）、梁巧萍（望覺協和堂）及黃耀昌（合一堂馬鞍山堂）同獲頒基督教研究文學碩士（MACS）。本年度進入神學院接受栽培之本會會友共四位，包括李家昕（屯門堂）及黃耀昌（合一堂馬鞍山堂）同修讀神道學碩士（MDiv），呂維國（望覺堂）及吳凱欣（灣仔堂）同修讀基督教研究文學碩士（MACS）（兼讀制）。
應屆畢業之公費神學生黃宇軒差往基灣堂事奉，已於8月1日履新。
原定於9月26日舉行之本年度區會中、小學「新聘教師座談會」，受疫情影響延至本日早上舉行，共有48位校長、16位校監及176位於本學年加入區會中、小學之新聘教師參與。
10、17及24日 於區會舉行共3講之本年度新入職同工課程。
18日 神學牧職部社會關注小組發出【呼籲信徒為香港祈禱】。
22日 本會退休校長、梁發紀念禮拜堂執事盧光輝校長主懷安息。
23日 下午宣教師團契於區會舉行團契聚會，主題：分Fun中需要您，共30人出席。
28日 總幹事發出【二零二零年將臨期總幹事牧函：過一個不一樣的聖誕節】。
福音事工部學校事工小組以ZOOM形式順利完成2020-2021年度青少年奮進向上計劃面試，本年度共接納57位同學的申請。
29日 陳誠東牧師外借往道風山基督教叢林擔任靈修導師，為期3年。
十二月
2日 因本地爆發第四波疫情，區會再度響應政府實施公務員在家工作安排，恢復大部份同工在家工作及在辦公室輪流當值；家庭支援服務中心亦暫停對外開放；總辦事處太子道西入口再度關閉。
4日 直屬幼稚園聯校教師發展日順利完成，是次主題「正向教育」，上午由陳嘉璐精神科醫生分享「譜出正向教育的旋律」，下午由香港大學心埋學系榮譽助理教授教育心理學家朱可達博士分享「正向家校合作策略」；因疫情關係，聚會以網上形式進行。
14日 原定於晚上舉行2020年度執行委員會聖誕聚餐，受疫情影響決定取消；原計劃在聚餐當晚頒發榮休同工及長期服務教牧、長執紀念品將另行安排。